长荣航空1989年3月正式成立，1991年7月1日正式开航。
2002年，长荣航空股票转上市交易。
2003年长荣航空参与执行首次台湾海峡两岸直航春节包机任务，开始海峡两岸直航台商包机业务。
2003年长荣航空成立欧洲货运中心。2005年荣获IATA评选为2004世界十大航空货运公司。
长荣航空拥有良好的飞行安全纪录，2004年，德国Aero International杂志评选长荣航空为全世界十大安全航空公司之一。2005年长荣航空成为台湾地区第一家以「零缺点、零建议事项」正式通过「国际航空运输协会作业安全查核认证（IOSA）」。
长荣航空继2003年陆续引进11架空中客车A330-200客机后，2005年起逐年引进 15架波音777客机，成为长荣航空机队主力。
截止2008年,长荣航空是台湾地区消费者心目中理想品牌调查国际航线第一名品牌。
长荣航空采客、货运并重的经营策略，客、货运比例已将近50%∶50%，营业额亦逐年成长。
波音777-300ER
长荣航空通航全球40余个城市。藉由与世界多家航空公司策略联营合作，形成全球客、货运航线网路。
客运合作伙伴：长荣航空与美国航空（American Airlines）美国大陆航空（Continental Airlines），全美航空（US Airways）、加拿大航空（Air Canada）、新西兰航空（Air New Zealand）、澳洲航空（Qantas）、日空航空（Air Nippon）以「共挂航班号」方式联营航线。
货运合作伙伴：英国航空（British Airways）、德国汉莎航空（Lufthansa）联营货运航线。
在长荣集团「挑战、创新、团队」的一贯企业文化下，长荣航空充分发挥「飞航安全快捷、 服务亲切周到、经营有效创新」的经营理念，创新服务品牌。以「分享让飞行更愉悦」为诉求，持续延伸服务领域，坚持以最好的品质，满足各种旅客不同的需求。无论在客舱规划、内装设备及整体服务品质，皆将追求最具国际化竞争实力的体质。
1991年长荣航空推出全球首创的「第四舱等」--长荣客舱，2005年引进的 B777-300ER客机并改名为「菁英舱」。2003年引进A330-200及2005年引进B777-300ER时，推出创新的顶级舱等--「桂冠舱」，配置AVOD（Audio/Video on Demand）自选互动式娱乐系统，提供超越头等舱的设备。2005年长荣航空引进的B777装备装置最高等级的电子飞行包(Electronic Flight Bag)，提升飞机的飞行安全层次。
长荣公司首创的-“长荣客舱”比普通经济舱座位长15公分，这样更加便于旅客在飞行过程中腿部更加舒适，长荣客舱位于长荣桂冠舱后部普通经济舱前部，共有七排，五十六个座位。
（截止2008年 8月）
空中客车A330-200 11架 • 2005年，与日本Sanrio合作推出的首架Hello Kitty彩绘涂装机首航东京，机型为 A330，2006年推出第二架涂装Hello Kitty图案的A330。
空中客车A320-200 1架（租赁复兴航空）
波音747-400 8架
波音777-300ER 11架
MD-90-30 3架
波音747-400F货机 8架
MD-11F货机 8架（其中三架为租赁）